결로만 말씀드리면, 메지는 온전한 방수층이 아니기 때문에, 액방으로 교반한 시멘트로 메지작업을 해도 됩니다.
따라서 액방으로 교반한 시멘트가 아닌 일반물로 교반한 시멘트로 메지작업을 해도 괜찮습니다.
실리콘의 경우 탄성이 있기 때문에 시멘트메지처럼 깨져서 탈락하는 경우는 거의 없겠지만, 곰팡이가 자라거나, 흰색실리콘의 경우에는 변색이 된다는 단점이 있습니다.

김실장님 감사합니다
중요한 걸 안 적었는데
업자들은 메지가 없어서 문와꾸 방향으로 물이 스며들 수 있다고 생각하더군요
그래서 실리콘이 낫지 않을까 하네요
백시멘트도 때끼기도 하고요

둘 다 무방합니다. 다만 너무 좁아서 시멘트를 묽게 해야 하는데, 그러면 지난한 작업이 될 수 있습니다.
실리콘이 맘에 가시면 실리콘으로 하셔도 되세요.

관리자님 감사합니다. 만약 저 상태가 방치되어 있어도 문와꾸 쪽으로 물이 새거나 그런 일은 거의 없나요?

방치되어 있는 것은 좋지 않습니다. 제가 벽의 구성 등을 알 수 없기에 딱히 정확한 답변이 아닙니다만.. 대개의 경우 타일 뒤로 물이 넘어가서 좋을 것은 없기에 그렇습니다.